人类的大脑分为左右两个半球，左脑主要掌管语言、计算及有关推理、思考、判断的功能，右脑主要掌管空间结构、图像、模仿、想象等形像知觉能力；珠算式心算的过程是一种综合性的思考和运动的结合，需一边瞬间记数，一边虚珠影像，一边模拟拨珠，一边珠像内化，它激化思维力、记忆力、注意力、空间想象力等来完成运算任务，因此珠算式心算进行时，需要左右两半脑协同活动，更重要是“虚盘”不断刺激右脑，让右脑得到更多的发展；同时一个人的智力发展与经常锻炼手指活动有密切关系，而拨算盘的动作则速度快且细致和微妙，更符合这个原则，也更有助于开发智力；所以说珠算式心算是开发儿童智力和潜能的金钥匙。
中央电视台十套《走进科学》栏目寻找心算超人(2008.09.08)这一期中，对具有超强心算能力的人群进行了科学的研究，发现学习了珠心算的人在计算时与普通人相比，大脑的右侧有着明显的区别，活动频率远远高于普通人，这就证明了珠心算的确可以开发人类的大脑。
我国各地珠心算教育的实践证明，学习珠心算的儿童与未参加学习的儿童相比，大脑的灵敏程度有显著差别，学习珠心算的儿童计算的快速性、观察的瞬时性、记忆的牢固性、想象的丰富性，均优于其它儿童。
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