福建省卫生职业技术学校临床医学专业于2008年通过教育部评估并开始招生。本专业为学院重点建设专业，所有专业教研室设在附属医院，专业课程主要由附属医院及行业专家承担，已形成一支高素质、结构合理的专兼结合教学团队。本专业实行“三年两段、六能双证”人才培养模式，培养具有为人民健康服务的职业道德，具有预防、保健、诊断、治疗、康复、健康管理等基层医疗卫生服务的能力，能够独立处理常见病、多发病、精神病和传染病，能够对急、危、重症疾病病人进行初步处理，能够向个人、家庭、社区提供公共卫生和基础医疗服务的技术技能型临床医学人才。拥有6所附属医院，5所教学医院，20余所实习医院，均为二级甲等以上医疗卫生机构，能够满足临床医学专业教学和技能训练需要。学院内还建有临床医学实训基地，其中新建实训大楼模拟医院场景设置建设助理执业医师实践技能考场，方便学生实践技能的训练，提高助理医师技能考试通过率。
二、核心课程
核心课程有：人体解剖学、生理学、病理学、药理学、诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学等，其中有2门课程被评为省级精品课程，有3门课程被评为院级精品课程。
三、专业证照
(1)学生毕业颁发福建省教育厅统一印制、国家教育部电子注册的专科毕业证书，毕业证书可在中国高等教育学生信息网上查询认证。
(2)在校期间可通过国家职业技能鉴定培训与考试，考取按摩保健师、公共营养师等国家职业资格证书，毕业后可依法报考国家助理医师执业资格证书。
四、就业方向及就业率
毕业后在各级各类基层医疗卫生机构(包括社区卫生服务中心/站、乡镇卫生院、村卫生所(室)、计生服务站、基层疾控中心等)。近三年毕业生就业率达100%。
五、继续教育
本专业应届毕业生可参加福建中医药大学、莆田学院等本科院校“专升本”考试，2015年毕业生专升本上线率名列全省同类院校前茅。
六、对外合作项目
我系开设校企(院)合作班，与宁德市医院联合开设临床医学定向班、与福州空军医院联合开设临床医学(影像诊断方向)班，实行“1+1+1”模式。第一年在校内学习专业基础课程，第二年在合作医院学习专业课程，第三年分散到全省各地二甲以上医院顶岗实习。“1+1+1”模式提前让学生接触职场环境，延长学生在临床岗位上学习专业技能的时间，提高了学生的岗位职业能力。
